Genetické testování na chronická onemocnění ledvin
Mar 10, 2022
další informace:ali.ma@wecistanche.com
Genetické testování chronických onemocnění ledvin: klinická užitečnost a bariéry vnímané nefrology
Michal Mrug a spol
Odůvodnění a cíl:
Identifikace patogenních variant v genech spojených schronické onemocnění ledvinmůže pacientům a nefrologům poskytnout užitečné informace, které jim pomohou při diagnóze a terapeutických plánech. Mnoho nefrologů však genetické testování nepoužívá, přestože náklady se časem snižují a dostupnost se zvyšuje.
Studovat design:
Provedli jsme průzkum, abychom odhalili představy obecných dospělých nefrologů o užitečnosti a překážkách genetického testování v klinické praxi.
Nastavení a účastníci:
Online průzkum byl zadán certifikovaným nefrologům (n =10 054) ve Spojených státech.
Analytický přístup:
Analyzovali jsme demografické charakteristiky respondentů průzkumu a jejich odpovědi v kontextu jejich využívání genetického testování v běžné klinické praxi.
Výsledek:
Průzkum dokončilo celkem 149 nefrologů, přičemž 72 procent (107 ze 149) uvedlo používání genetických testů ve své praxi. V průměru byly testy objednány pro 3,8 procenta jejich populace pacientů. 35 procent odpovědí nefrologů bez anamnézy genetických testů označilo vnímané bariéry jako „extrémně významné“ ve srovnání s 23 procenty odpovědí od těch, kteří dříve genetické testy použili. Uživatelé i neuživatelé genetických testů však naznačovali vysoké náklady (uživatelé: 46 procent, 49 ze 107; neuživatelé 69 procent, 29 ze 42) a špatnou dostupnost nebo nedostatek jednoduchosti (uživatelé: 33 procent, 35 ze 107; neuživatelé: 57 procent; 24 ze 42) genetického testování jako nejvýznamnější vnímané překážky implementace.
Omezení:
Průzkum použitý v této studii nebyl dříve validován; navíc kvůli relativně malému počtu odpovědí mohlo mezi respondenty docházet k výběrovému zkreslení.
Závěry:
Ačkoli většina nefrologů uvedla, že genetické testy používají v klinické praxi, vysoké náklady a špatná dostupnost nebo nedostatek snadného použití byly vnímány jako nejdůležitější překážky pro rutinní přijetí. Tato pozorování naznačují, že vzdělávací programy, které pokrývají řadu témat, od genetikychronické onemocnění ledvink výběru testu, může pomoci zmírnit tyto bariéry a zlepšit používání genetické testovací innefrologické praxe.
Cistanche je dobrýchronické onemocnění ledvin
Chronické onemocnění ledvin(CKD) je významnou výzvou pro veřejné zdraví, s malým počtem léčebných terapií a prevalencí w15 procent ve Spojených státech.1 V roce 2017 CKD(cchronické onemocnění ledvin)postihlo 700 milionů lidí na celém světě, což vedlo k 1,2 milionu úmrtí.2 V nejzávažnějších případech CKD progreduje do konečného stadianemoc ledvin, která vyžaduje nákladné terapie náhrady ledvin, jako je dialýza nebo transplantace ledvin.3 Středně pokročilé CKD(cchronické onemocnění ledvin)může také způsobit multiorgánové komplikace, které zvyšují morbiditu a mortalitu. Například CKD je hlavním rizikovým faktorem kardiovaskulárních onemocnění. V roce 2017 úmrtí v důsledku CKD(cchronické onemocnění ledvin)a kardiovaskulární onemocnění přisuzované CKD představovalo 4,6 procenta celosvětové mortality ze všech příčin.2
Více než 30 procent pacientů s CKD uvádí rodinnou anamnézu.4 Navíc lze patogenní variantu (nazývanou také mutace) v jediném genu identifikovat u 10 procent dospělých pacientů s CKD5, přičemž dosud bylo identifikováno více než 500 monogenních variant spojených s onemocněním. 4 Ačkoli příspěvek mnoha dalších variant k patogenezi dospělých CKD(cchronické onemocnění ledvin) zůstává neznámé6, charakterizace těchto genů a proteinů, které kódují, nadále posouvá pochopení kauzality CKD. Kromě toho tyto objevy umožnily vývoj cílených diagnostických, prognostických a terapeutických strategií pro tyto poruchy.
Léčba genetických a získaných forem CKD(cchronické onemocnění ledvin) se mohou lišit a určit základní příčinu CKD(cchronické onemocnění ledvin)použití tradičních diagnostických nástrojů může být náročné.7 Identifikace patogenních genových variant v genech spojených s CKD může pacientům a nefrologům poskytnout užitečné informace, které mohou pomoci při stanovení diagnózy, pomoci s vývojem terapeutických plánů a vést k doporučení pro léčbu extrarenálních komplikací. Dále stanovení genetické příčiny CKD(cchronické onemocnění ledvin) nebo koncová fázenemoc ledvinmůže ovlivnit lékařskou péči členů rodiny pacienta. Například stanovení genetické diagnózy může vést k testování a screeningu rodinných příslušníků a výsledky takového testování mohou přímo informovat jejich lékařský management (např. včasná diagnóza a lékařská péče, plánování rodiny nebo výběr žijících dárců pro transplantaci). ). Kromě toho identifikace patogenního CKD(cchronické onemocnění ledvin) genové varianty mohou poskytnout diagnostické informace doplňující nebo místo biopsie ledviny Historicky se genetické testování u pacientů s CKD(cchronické onemocnění ledvin) byla omezena vysokými náklady na sekvenování DNA. Pokroky v sekvenování nové generace však umožnily vývoj několika levnějších klinických platforem nabízejících simultánní testování více CKD(cchronické onemocnění ledvin)Navzdory pokroku v technologii a sníženým nákladům však genetické testování nebylo široce přijato nefrology. Abychom identifikovali důvody tohoto nedostatečného využití, provedli jsme průzkum u nefrologů praktikujících ve Spojených státech ohledně jejich současných postupů a vnímané užitečnosti genetického testování, jakož i překážek pro přijetí těchto testů.
METODY
Design a obsah průzkumu
Vyvinuli jsme 29-online průzkum s otázkami na základě předchozích průzkumů trhu a skupin zaměřených na pacienty, které provedla společnost Natera, Inc. Průzkum obsahoval otázky s více možnostmi výběru, hodnocení a vyplnění prázdných otázek (tabulka S1). pokud jde o vnímané potenciální bariéry genetického testování, respondenti seřadili každou z poskytnutých kategorií na stupnici od 1 (není bariéra) do 5 (významná bariéra). Účastníci průzkumu také hodnotili důležitost různých potenciálních typů podpory pro snazší objednávání genetických testů na stupnici od 1 (nedůležité) do 5 (mimořádně důležité). U otázek týkajících se identifikace klinických scénářů a specifických klinických diagnóz, pro které může mít genetické testování hodnotu, bylo účastníkům umožněno vybrat více kategorií.
Šíření a studijní vzorek
Průzkum pořádala společnost Survey HealthcareGlobus, která k identifikaci a správě potenciálních respondentů průzkumu používala technologickou sadu s vlastním panelem odborníků z oblasti zdravotnictví. Průzkum byl distribuován 10 054 nefrologům ve Spojených státech prostřednictvím e-mailu (Americká rada pro vnitřní lékařství oznámila 10 901 nefrologů s platnou certifikací ve Spojených státech v roce 20209). Respondenti byli požádáni, aby odpověděli na screeningové otázky, aby si přezkoumali svou způsobilost, než přistoupí k otázkám průzkumu (tabulka S1). Kritéria vyloučení zahrnovala následující: (i) výběr specializace, která nebyla obecnou nefrologií dospělých (tj. transplantnefrologie, dětská nefrologie, chirurgie, jiné), (ii) necertifikovaná v obecné nefrologii nebo (iii) praktikování nefrologie po dobu kratší než 2 roky. let. Respondenti, kteří průzkum dokončili, obdrželi od pořadatele průzkumu honorář 35 USD. Průzkum byl zveřejněn ve 2 fázích v červenci 2020 a byl uzavřen 16 dní po prvním spuštění, jakmile bylo získáno 150 vhodných odpovědí.
Veškerou administraci průzkumu a upomínkové e-maily a platby za dokončení průzkumu provedla společnost Survey Healthcare Globus. Společnost Natera, Inc. se nepodílela na výběru účastníků, administraci průzkumu ani inzerci průzkumu. Průzkum nenaznačoval, že byl vyvinut nebo sponzorován společností Natera, Inc. Tato studie nezahrnovala žádné údaje o pacientech; spíše se jednalo o průzkum lékařů a jejich postojů ke genetickému testování. Studie tak byla vyňata z požadavků institucionální kontrolní komise. Všichni respondenti souhlasili s účastí v průzkumu a informovaný souhlas nebyl potřeba, protože nebyly shromážděny žádné údaje týkající se zdraví.
Cistanche je dobrýchronické onemocnění ledvin
Analýza dat
Byly provedeny deskriptivní statistické analýzy s cílem shrnout demografické údaje a četnost odpovědí v průzkumu. Srovnání zvyků při objednávání testů na základě úrovně vzdělání byla analyzována pomocí Kruskal-Wallistest (P-hodnota<0.05 was="" considered="" significant).="" an="" analysis="" of="" questions="" involving="" the="" ranking="" of="" barriers="" and="" resources="" was="" performed="" by="" the="" quantification="" of="" the="" responses="" using="" the="" 5="" (significant="" barrier="" or="" extremely="" important)="">
VÝSLEDEK
Demografická data
Of the 10,054 nephrologists contacted, 209 responded to the 29-question survey (gross response rate of 2.1%). However, 60 responses were excluded because of ineligibility (n = 50), incompletion of the survey (n = 9), or invalid responses (n = 1). In a final cohort of 149 respondents (effective response rate of 1.5%), general nephrologists represented 35 states (including the District of Columbia), with the largest proportion of 38.9% (58 of 149) located in the southern region, consistent with the breakdown of US board-certified nephrologists in 2020, as reported by the American Board of Internal Medicine (Table 1).9 Sixty-nine percent (n = 103) of the survey respondents worked in private practice settings, with 29% (n = 43) in large practices of >10 poskytovatelů a 40 procent (n=60) v malých praktikách s<10 providers,="" which="" was="" consistent="" with="" data="" regarding="" the="" nephrology="" workforce="" reported="" by="" the="" american="" medical="" association.10="" the="" largest="" proportion="" of="" respondents="" (46%;="" n="69)" practiced="" nephrology="" for="" a="" period="" of="" 10-20="" years="" (table="">
Trendy v použití genetických testů pro CKD(cchronické onemocnění ledvin)Mezi všeobecnými nefrology
Ze 149 respondentů (tj. nefrologů), kteří tvoří konečnou kohortu, 107 (72 procent) uvedlo, že si objednalo v průměru větší nebo roven 1 genetickému testu za měsíc (označení jako „uživatelé“), zatímco 42 (28 procent) uvedlo průměr objednání 0 genetických testů za měsíc (označení jako „neuživatelé“); Je možné, že „neuživatelé“ si také objednali genetické testy, ale v rychlosti<1 per="" month.="" the="" median="" number="" of="" genetic="" tests="" reported="" by="" "users"="" with="" a="" history="" of="" orders="" was="" 2="" per="" month="" (range:="" 1-100).="" the="" average="" proportion="" of="" patients="" for="" whom="" genetic="" tests="" were="" ordered="" was="" 3.8%="" (sd="" 7.4%).="" eighty-three="" percent="" (n="89)" of="" the="" respondents="" indicated="" that="" they="" tested="" ≤5%="" of="" their="" patients,="" whereas="" 49%="" (n="52)" indicated="" that="" they="" tested=""><1% of="" their="" patient="" population="" (fig="">
Vzpomínka na předchozí školení v oblasti genetiky mezi nefrology
Abychom porozuměli vztahu mezi školením v genetice a používáním genetického testování mezi nefrology, respondenti průzkumu seřadili své vzdělání v genetice: 21 procent (n=31) uvedlo "rozsáhlé", 72 procent (n=108 )uvedlo "omezené" a 7 procent (n=10) uvedlo, že se v genetice nevzdělávají předem. Porovnáním hlášených počtů testů objednaných za měsíc při stratifikaci podle úrovně vzdělání každého respondenta v genetice vyšlo najevo, že nefrologové s „extenzivním“ vzděláním v genetice objednávali v průměru více genetických testů (20,2 ± 27,7) než ti, kteří "omezené" (3,1 ± 6,1) nebo žádné vzdělání (0,3 ±0,4; P < 0,001)="" (obr.="">
Vnímaná užitečnost genetického testování v obecné nefrologii
Nastavení Dotazovaní nefrologové byli požádáni, aby identifikovali klinické scénáře, ve kterých se domnívají, že genetické testování má největší hodnotu z poskytnutých kategorií: (i) všichni pacienti s CKD(cchronické onemocnění ledvin), (ii) pacientů s CKD(cchronické onemocnění ledvin)neznámé etiologie, (iii) pacienti se specifickými klinickými diagnózami nebo (iv)pediatričtí pacienti. Většina, bez ohledu na jejich historii používání genetického testování, uvedla, že genetické testování je nejcennější pro pacienty se specifickými klinickými diagnózami (uživatelé: 75 procent , 80 ze 107; neuživatelé: 86 procent , 36 ze 42) a hodnocení pacientů s CKD(cchronické onemocnění ledvin)neznámé etiologie (uživatelé: 69 procent, 74 ze 107; neuživatelé: 38 procent, 16 ze 42; tabulka 2). Specifické klinické diagnózy, u kterých bylo genetické testování indikováno jako nejhodnotnější, byly cystická onemocnění (uživatelé: 69,2 procenta, 74 ze 107; neuživatelé: 76,2 procenta, 32 ze42) a glomerulární onemocnění (uživatelé: 56,1 procenta, 60 ze 107; neuživatelé: 52,4 procenta, 22 ze 42) (tabulka 2).
Vnímané genetické bariéry
TestováníNefrologové seřadili každou z 5 potenciálních překážek použití genetických testů (náklady na testování, dostupnost nebo nedostatek snadného testování, přístup k odborníkům na genetiku, nedostatek prokázané klinické užitečnosti, znalosti o interpretaci výsledků) na stupnici od 1 (nejméně významné) do 5 ( nejvýznamnější) (n=730 odpovědí). Největší podíl odpovědí od neuživatelů byl hodnocen jako „5“ (35 procent , 74 z 210), zatímco nejvyšší podíl odpovědí od uživatelů (33 procent, 172 z 520) zaznamenal překážky jako „4“ v bodě 5- škála (obr. 2A). Bez ohledu na jejich historii používání genetických testů nefrologové uvedli, že náklady na testování pro pacienty byly nejvýznamnější překážkou (uživatelé: 46 procent, 49 ze 107; neuživatelé 69 procent, 29 ze 42). Druhou nejvýznamnější překážkou byla špatná dostupnost nebo nedostatek snadného testování (uživatelé: 33 procent, 35 ze 107; neuživatelé: 57 procent; 24 ze 42). Nejméně významnými hlášenými překážkami byla nedostatečná provenklinická užitečnost a nedostatek znalostí o interpretaci výsledků (obr. 2B).
Vnímaná užitečnost zdrojů, které mohou překonat bariéru genetického testování
Nefrologové také seřadili důležitost 4 zdrojů, které byly navrženy k překonání bariér genetického testování, na stupnici od 1 (není důležité) do 5 (extrémně důležité) (n=596 odpovědí). Všechny poskytnuté zdroje byly považovány za mimořádně důležité, přičemž 46 procent (273 z 596) z celkového počtu odpovědí spadalo do kategorie „5“ (tabulka 3). Dále respondenti průzkumu uvedli vysoký zájem o všechny možnosti vzdělávacích zdrojů pro lékaře a pacienty (tabulka 3).
DISKUSE
Genetické testování změnilo diagnostické, prognostické a terapeutické přístupy k mnoha dědičným poruchám, včetně CKD(cchronické onemocnění ledvin). Rozsah přijetí praktik genomické medicíny, včetně genetického testování a innefrologie, však zůstává nízký.10 Proto jsme provedli průzkum, abychom porozuměli vnímání a překážkám, které mohou mít nefrologové vůči používání genetických testů, a abychom identifikovali aspekty, ve kterých mohou být vzdělávací zdroje užitečné. Průzkum nebyl zamýšlen jako vodítko pro rozhodování klinického managementu na základě výsledků genetického testování.
Naše studie odhalila, že většina nefrologů, kteří odpověděli na náš průzkum, v minulosti používali genetické testování (72 procent) a že oceňují jeho hodnotu při léčbě dědičných forem CKD.(cchronické onemocnění ledvin). Nejvyšší vnímaná užitečnost byla pozorována u CKD(cchronické onemocnění ledvin)neznámé etiologie a cystická a glomerulární onemocnění. Tyto výsledky naznačují, že obecní nefrologové chápou hodnotu genetického testování, zejména v klinických kontextech, které pravděpodobně poskytnou genetickou diagnózu. Proto se očekává, že lepší porozumění relevantním genetickým faktorům, které přispívají ke ztrátě funkce ledvin (např. prostřednictvím vzdělávacích programů), podpoří širší přijetí genetického testování obecnými nefrology. Například bylo prokázáno, že genetické testování odhalilo dědičné příčiny až ve 20 procentech případů CKD(cchronické onemocnění ledvin)s neznámou etiologií5 a může vést k reklasifikaci klinických diagnóz ve 20 procentech případů.4,7,11 Identifikace patogenních variant u CKD(cchronické onemocnění ledvin)související geny mohou také informovat o prognóze a léčbě. Pro některé dobře charakterizované genetické poruchy, jako jsou autozomálně dominantní polycystické poruchy, jsou v současnosti dostupné terapie schválené Úřadem pro kontrolu potravin a léčiv.ledvinachoroba.12 Navíc lepší porozumění genetickým etiologiímledvinanemocímůže být zdrojem informací pro vývoj nových terapeutických strategií pro tato onemocnění (např. nefronoftíza; přehled ve studii Stokmana et al13 a Slaats et al14). Navíc, podtypy CKD(cchronické onemocnění ledvin)může často sdílet fenotypový přesah s jinými nemocemi, jako je Alportův syndrom – nejčastější dědičná forma glomerulárního CKD(cchronické onemocnění ledvin)— což je způsobeno patogenními variantami v genech COL4A3, COL4A4 nebo COL4A5 a nefrotický syndrom rezistentní na steroidy, který je spojen s variantami ve více než 40 genech.15 Jiné formy CKD(cchronické onemocnění ledvin)které se obecně považují za získané, jako jsou hypertenzní a diabetické nefropatie, u nichž jen málo nefrologů v našem průzkumu uvedlo potenciální hodnotu v genetickém testování, mohou mít také dědičné složky.16-19 Progrese hypertenze a glomerulárníledvinanemocíje také spojena s genetickými rizikovými faktory, jako jsou varianty v APOL1, které jsou přítomny v 10 procentech afroamerické populace.20 Použití genetického testování k identifikaci takto rizikových jedinců může umožnit implementaci raných cílených intervenčních programů pro osoby se zvýšeným rizikem rozvoje CKD(cchronické onemocnění ledvin)Naše zjištění také odhalila, že 28 procent nefrologů ve své praxi nepoužilo genetické testy. Tato hodnota mohla hrubě podcenit skutečný podíl neuživatelů genetických testů, vzhledem k nízké míře odpovědí na náš průzkum a možnosti, že uživatelé genetických testů mohli na tento průzkum reagovat s větší pravděpodobností. Tato zjištění jsou v souladu s výsledky nedávné studie postojů k používání genetického testování mezi nefrologickými lékaři v Austrálii.21 Vysoký podíl nefrologů, kteří genetické testy nepoužili, je potenciálním problémem v kontextu w10 procent CKD(cchronické onemocnění ledvin)příčin, které jsou připisovány patogenním variantám v jednotlivých genech.5 Zvýšené používání genetického testování může pomoci při identifikaci těchto pacientů a pomoci při jejich léčbě.
Cistanche je dobrýchronické onemocnění ledvin
Podobně jako v naší studii Jayasinghe et al21 zjistili, že většina poskytovatelů považuje genetické testování za užitečné při léčbě pacientů s podezřením na genetické formy CKD(cchronické onemocnění ledvin). Celkově vzato, vnímání vysoké užitečnosti, ale nízkého využití genetického testování naznačuje, že jeho širšímu použití nefrology brání významné bariéry. Naše studie identifikovala několik logisticky vnímaných bariér, z nichž nejvýznamnější byly vysoké náklady na genetické testy. Podle údajů Národního institutu pro výzkum lidského genomu však náklady na sekvenování 1 Mb (milion bází) klesly z 5 292,39 USD v roce 2001 na 0,008 USD v roce 2020, díky čemuž jsou přístupy sekvenování nové generace mnohem dostupnější a proveditelnější.22 Testování nové generace založené na sekvenování je nákladově efektivnější než jednogenové přístupy u nemocí, u kterých může být klinická diagnóza obtížná23 a může být často levnější než diagnostické přístupy, jako je biopsie ledvin.24 Přestože naše studie nezahrnovala analýzu vnímaných náklady na genetické testování, rychlý pokles nákladů na sekvencování příštích generací a rozšíření možností testování naznačují, že je zapotřebí další vzdělávání o nákladové efektivitě genetického testování.
Naše studie také identifikovala nedostatek jednoduchosti procesu objednávání genetických testů jako překážku mezi nefrology (uživateli i neuživateli genetických testů). Nemožnost určit vhodný genetický test byla také nedávno identifikována jako hlavní překážka použití genetických testů nefrology.21 Nedávná studie ukázala, že přibližně polovina genetických testů objednaných negenetickými poskytovateli nebyla tou nejvhodnější možností, jak bylo stanoveno na základě pacientovy klinické anamnézy. a že výběr správných testů vedl ke snížení nákladů jak pro praxi, tak pro pacienty.25 V našem průzkumu jsme identifikovali pozitivní souvislost mezi úrovní genetického vzdělání a počtem testů objednaných u nefrologů. Toto zjištění naznačuje, že poskytování vzdělávacích zdrojů v genetice může zvýšit pohodlí lékařů při používání genetického testování v jejich praxi.
Mezi charakteristikami nefrologa, na které jsme v naší analýze stratifikovali (včetně oblasti USA a typu instituce), bylo genetické vzdělání jedinou charakteristikou, která poskytla významné rozdíly ve vzorcích uspořádání (obr. S1, tabulka S2). Navzdory rozdílům ve vzorcích řazení na různých úrovních genetického vzdělání byl význam bariér všemi skupinami vnímán podobně (tabulka S3). Tyto nálezy naznačují, že všichni běžní nefrologové mohou mít prospěch z šíření vzdělávacích zdrojů.
Obrázek 1. Frekvence řazení genetických testů a její vztah ke genetickému vzdělání u amerických nefrologů. (A) Frekvence objednávání genetických testů byla vypočtena mezi "uživateli" (n=107) na základě hlášeného počtu testů objednaných za měsíc a počtu unikátních pacientů viděných za měsíc pro každého respondenta. Podíl nefrologů, kteří objednali genetické testy pro<1% of="" their="" patients="" was="" 48.6%.="" (b)="" the="" reported="" number="" of="" tests="" ordered="" per="" month="" was="" stratified="" by="" the="" level="" of="" education="" in="" genetics="" indicated="" by="" each="" respondent="" (n="149)." a="" positive="" relationship="" was="" identified="" between="" physician="" education="" in="" genetics="" and="" the="" number="" of="" genetic="" tests="" ordered="" per="" month.="" nephrologists="" with="" prior="" education="" in="" genetics="" ordered="" more="" genetic="" tests="" than="" those="" with="" no="" such="" education.="" similarly,="" those="" with="" extensive="" education="" in="" genetics="" ordered="" genetic="" tests="" more="" frequently="" than="" those="" with="" only="" limited="" education.="" *p="" <="" 0.05.="" ****p="" <="" 0.0001="" by="" kruskal-wallis="">
Náš průzkum odhalil velký zájem o vzdělávací zdroje zahrnující více témat, od genetiky, která je základem CKD(cchronické onemocnění ledvin)na pojistné důsledky. Dvě nedávné studie podobně ukázaly, že nefrologové označili nepohodlí při mluvení s pacienty o výsledcích26 a interpretaci výsledků genetických testů za problém při implementaci testu.21 Kromě interpretace výsledků náš průzkum naznačil potřebu zdrojů, které by nefrologům pomohly usnadnit diskuse s pacienty o potenciální výhody, omezení a rizika genetického testování. Mezi respondenty byl velký zájem o to, aby byl přístup ke genetickým poradcům poskytnut lékařům i pacientům jako potřebný zdroj (tabulka 3). Genetičtí poradci a další odborníci na genetiku mohou identifikovat vhodné testovací strategie, interpretovat výsledky a určit vhodný screening presymptomatických příbuzných rodinných příslušníků.27 Dostupnost těchto zdrojů pro nefrologické praktiky tedy může zmírnit váhavost lékařů i obavy pacientů, což může vést k širšímu přijetí. genetického testování. Kromě toho laboratoře nabízející genetické testování na CKD(cchronické onemocnění ledvin)měli by implementovat komplexní vzdělávací strategie a zdroje pro lékaře pokrývající témata, jako jsou současné náklady na různé možnosti genetického testování a genetické testování a procesy účtování, a iniciovat diskuse s pacienty před a po provedení genetického testování.
Hlavním omezením současné studie je, že není známo, jak dobře naše odpovědi z průzkumu reprezentují celou zkoumanou skupinu nefrologů. Vzhledem k malé velikosti vzorku a nízké míře odpovědí je možné, že odpovědi v průzkumu byly zkreslené. Uživatelé genetických testů mohli být více motivováni k tomu, aby reagovali na průzkum, což vedlo k silně převáženému odběru vzorků vůči častým uživatelům genetických testů. Takové zkreslení může vysvětlit relativně vysoký podíl pacientů, u kterých bylo nařízeno genetické testování, ze všech pacientů sledovaných jednotlivými nefrology. Navzdory potenciálu zkreslení poskytuje tato studie cenné informace související s vnímáním genetického testování mezi nefrology, ať už v minulosti nebo bez použití genetických testů. Dalším problémem je přesnost poskytnutých odpovědí; je to proto, že tento průzkum nebyl administrován přímo výzkumnými pracovníky a vycházel z názorů respondentů. Například některé odpovědi poskytnuté na počet objednaných genetických testů (např. 100 za měsíc) se zdají příliš vysoké. A konečně, vzhledem k relativně malému počtu odpovědí byla tato studie nedostatečná, aby umožnila stratifikaci založenou na konkrétních odpovědích a následných mediačních analýzách.
Na závěr náš průzkum vrhá světlo na klinickou užitečnost, výhody a vnímané překážky používání genetických testů mezi obecnými nefrology. Tato pozorování mohou podpořit vývoj vzdělávacích programů, které se starají o větší uznání používání genetických testů, což může pomoci s léčbou pacientů a zlepšit formální praktické pokyny pro použití genetického testování v nefrologické praxi.
DOPLŇKOVÝ MATERIÁL
Doplňkový soubor (PDF)
Obrázek S1: Trendy řazení genetických testů mezi americkými nefrology rozdělené podle regionu a typu instituce.
Tabulka S1: Otázky průzkumu
Tabulka S2: Vzorce použití genetického testování u respondentů průzkumu
Tabulka S3: Vnímané bariéry genetického testování (úroveň genetického vzdělání)
INFORMACE K ČLÁNKU
Celá jména autorů a akademické tituly:
Michal Mrug, MD, Michelle S. Bloom, Ph.D., Christine Seto, MBA, MeenakshiMalhotra, Ph.D., Hossein Tabriziani, MD, Philippe Gauthier, MD, MBA, Vicki Sidlow, MS, MBA, Trudy McKanna, MS , CGC a Paul R. Billings, MD, Ph.D.
Afiliace autorů:
Department of Medicine, The University of Alabama at Birmingham (MMR) a Department of VeteransAffairs Medical Center (MMR), Birmingham, Alabama; a Natera, Inc (MSB, CS, MMA, HT, PG, VS, TM, PRB), San Carlos, Kalifornie.
Adresa pro korespondenci:
Michal Mrug, MD, Divize nefrologie, University of Alabama v Birminghamu, 1900 UniversityBlvd, THT 611J, Birmingham, AL 35294. E-mail: mmrug@uab.edu
Příspěvky autorů:
Design studie: MMR, CS, TM; analýza dat:CS, MSB; interpretace dat: TM, MSB, VS, MMR; supervizní ormentorství: HT, PG, VS, PRB, MMA. Každý autor přispěl důležitým intelektuálním obsahem během navrhování nebo revizí rukopisu a přijímá odpovědnost za celkové dílo tím, že zajistí, že otázky týkající se přesnosti nebo integrity jakékoli části díla budou náležitě prošetřeny a vyřešeny.
Podpěra, podpora:
Natera, Inc. poskytovala podporu pro vývoj průzkumu, šíření, honoráře, analýzy, psaní a odesílání rukopisu. Dr. Mrug byl také částečně podporován National Institute of Diabetes and Digestive andOnemocnění ledvingrantU54 DK126087 (prostřednictvím Childhood CysticNemoc ledvinCore Center), grant amerického ministerstva VA 1-I01-BX004232-01A2 (prostřednictvím Office of Research and Development, MedicalResearch Service) a Detraz Endowed Research Fund in Polycystic Kidney Disease .
Finanční zveřejnění:
Dr. Mrug uvádí poplatky za konzultace související s touto prací od společnosti Natera Inc. a uvádí granty a poplatky za konzultace mimo předloženou práci od společností Otsuka Pharmaceuticals, Sanofi, Palladio Biosciences, Chinook a Goldilocks Therapeutics. DrsBloom, Malhotra, Tabriziani, Gauthier, Billings a AuthorsSeto, Sidlow a McKanna jsou zaměstnanci a akcionáři společnosti Natera, Inc.
Peer Review:
Přijato 13. května 2021. Hodnotili 3 externí recenzenti s přímým redakčním vstupem od statistického redaktora, přidruženého redaktora a šéfredaktora. Přijato v revidované podobě 16. srpna 2021.
Od: ' Genetické testování proChronická onemocnění ledvin: Klinická užitečnost a bariéry vnímané nefrologyMichal Mrug a spol
---Ledviny Med Vol 3|Číslo 6|listopad/prosinec 2021
REFERENCE
1. Centra pro kontrolu a prevenci nemocí.Chronické onemocnění ledvinve Spojených státech, 2019. Vol 2021. Přístupné 20. ledna 2021. https://www.cdc.gov/kidneydisease/pdf/201 9_National-Chronic-Kidney-Disease-Fact-Sheet.pdf
2. Bikbov B, Purcell CA, Levey AS, et al. Globální, regionální a národní zátěžchronické onemocnění ledvin, 1990–2017: systematická analýza pro studii Global Burden of Disease 2017. Lancet. 2020;395(10225):709-733.
3. Webster AC, Nagler EV, Morton RL, Masson P.Chronické onemocnění ledvin. Lanceta. 2017;389(10075):1238-1252.
4. Connaughton DM, Kennedy C, Shril S, et al. Monogenní příčinychronické onemocnění ledvinu dospělých. Kidney Int. 2019;95(4): 914-928.
5. Hays T, Groopman EE, Gharavi AG. Genetické testování pronemoc ledvinneznámé etiologie. Kidney Int. 2020;98(3):590-600.
6. Vivante A, Skorecki K. Zavádění rutinního genetického testování u pacientů s CKD(cchronické onemocnění ledvin). Nat Rev Nephrol. 2019;15(6):321-322.
7. Groopman EE, Marasa M, Cameron-Christie S, a kol. Diagnostická užitečnost sekvenování exomu pronemoc ledvin. N Engl J Med. 2019;380(2):142-151.
8. Cocchi E, Nestor JG, Gharavi AG. Klinický genetický screening u dospělých pacientů snemoc ledvin. Clin J Am Soc Nephrol. 2020;15(10):1497-1510.
9. Medicína ABoI. Certifikovaní kandidáti – všichni kandidáti. Vol 20212020. Zpřístupněno 21. února 2021. https://www.abim. org/about/statistics-data/candidates-certified.aspx.
10. Nadkarni GN, Horowitz ČR. Genomika v CKD(cchronické onemocnění ledvin): Je to cesta vpřed? Adv Chronic Kidney Dis. 2016;23(2):120-124.
11. Lata S, Marasa M, Li Y, a kol. Sekvenování celého exomu u dospělých schronické onemocnění ledvin: pilotní studie. Ann Intern Med. 2018;168(2):100-109.
12. Chebib FT, Perrone RD, Chapman AB, et al. Praktický průvodce pro léčbu rychle progredující ADPKD tolvaptanem. J Am Soc Nephrol. 2018; 29(10):2458-2470.
13. Stokman MF, Renkema KY, Giles RH, Schaefer F, Knoers NV, van Eerde AM. Rozšiřující se fenotypová spektraonemocnění ledvin:poznatky z genetických studií. Nat Rev Nephrol. 2016;12(8):472-483.
14. Slaats GG, Lilien MR, Giles RH. Nefronoftíza: měli bychom se zaměřit na cysty nebo fibrózu? Pediatr Nephrol. 2016;31(4): 545-554.
15. Bullich G, Domingo-Gallego A, Vargas I a kol. Genový panel onemocnění ledvin umožňuje komplexní genetickou diagnostiku cystické a glomerulární dědičnostionemocnění ledvin. Kidney Int. 2018;94(2):363-371.
16. Newton-Cheh C, Johnson T, Geneva V, et al. Celogenomová asociační studie identifikuje osm lokusů spojených s krevním tlakem. Nat Genet. 2009;41(6):666-676.
17. Liu C, Kraja AT, Smith JA, et al. Metaanalýza identifikuje běžné a vzácné varianty ovlivňující krevní tlak a překrývající se s lokusy metabolických vlastností. Nat Genet. 2016;48(10):1162-1170.
18. Saxena R, Voight BF, Lyssenko V, et al. Analýza asociace v celém genomu identifikuje lokusy pro diabetes 2. typu a hladiny triglyceridů. Věda. 2007;316(5829):1331-1336.
19. Voight BF, Scott LJ, Steinthorsdottir V, et al. Dvanáct lokusů náchylnosti k diabetu 2. typu identifikovaných pomocí rozsáhlé asociační analýzy. Nat Genet. 2010;42(7):579-589.
20. Parsa A, Kao WH, Xie D, a kol. Rizikové varianty APOL1, rasa a progresechronické onemocnění ledvin.N Engl J Med. 2013;369(23):2183-2196.
21. Jayasinghe K, Quinlan C, Mallett AJ, a kol. Postoje a praxe australských nefrologů k implementaci klinické genomiky. Kidney Int Rep. 2021;6(2):272-283.
22. Wetterstrand KA. Náklady na sekvenování DNA: údaje z programu sekvenování genomu NHGRI (GSP). Vol 2021. Přístupné 25. března 2021.www.genome.gov/sequencing cost data 23. Xue Y, Ankala A, Wilcox WR, Hegde MR. Řešení molekulárně diagnostického testovacího hlavolamu pro mendelovské poruchy v éře sekvenování nové generace: sekvenování jednoho genu, genového panelu nebo sekvenování exomu/genomu. Genet Med. 2015; 17(6):{10}}.
24. Jayasinghe K, Stark Z, Kerr PG, et al. Klinický dopad genomického testování u pacientů s podezřením na monogenitunemoc ledvin. Genet Med. 2021;23(1):183-191.
25. Haidle JL, Sternen DL, Dickerson JA, et al. Genetičtí poradci šetří náklady v celém spektru genetického testování. Am J Manag Care. 2017;23(10 Spec No): SP428-SP430.
26. Spiech KM, Tripathy PR, Woodcock AM, et al. Implementace programu precizní medicíny ledvin: postoje a přijetí lékaře. Život (Basilej). 2020; 10(4):32.
27. Thomas CP, Freese ME, Onda A, et al. Počáteční zkušenosti z kliniky renální genetiky ukazují zřetelnou roli v léčbě pacientů. Genet Med. 2020;22(6):1025-1035.
