Část Ⅰ Používání antibiotik pacienty COVID-19 s komorbiditami: Riziko zvýšené antimikrobiální rezistence

Abstraktní

Antimikrobiální rezistence (AMR) je celosvětový zdravotní problém, který hraje významnou roli v morbiditě a mortalitě, zejména u imunokompromitovaných pacientů. Stává se také vážnou hrozbou pro úspěšnou léčbu mnoha bakteriálních infekcí. Rozšířené a irelevantní používání antibiotik v nemocnicích a místních klinikách je hlavní příčinou AMR. Podle tohoto scénáře byla studie provedena v nemocnici terciární péče v Láhauru v Pákistánu od 2. srpna 2021. do 31. října 2021 s cílem zjistit prevalenci bakteriálních infekcí a míru AMR u pacientů s COVID-19 přijat na chirurgické jednotky intenzivní péče (JIP). Od pacientů byly odebrány klinické vzorky a přistoupili jsme k identifikaci bakteriálních izolátů, poté následovalo testování citlivosti na antibiotika (AST) pomocí diskové difúzní metody Kirby Bauer a minimální inhibiční koncentrace (MIC). Údaje o dalších komorbiditách byly rovněž sbírány ze zdravotní dokumentace pacienta. Současná studie ukázala, že nejčastějšími patogeny byly E. coli (32 procent) a Klebsiella pneumoniae (17 procent). Většina E. coli byla rezistentní na ciprofloxacin (16,8 procenta) a ampicilin (19,8 procenta). Klebsiella pneumoniae byla odolnější vůči ampicilinu (13,3 procenta) a amoxicilinu (12,0 procenta). Nejčastější komorbiditou bylo chronické onemocnění ledvin (CKD) a infekce močových cest (UTI). Přibližně 17 různých typů antibiotik, karbapenem, fluorochinolony, aminoglykosidy a chinolony, bylo vysoce převládající u pacientů na JIP. Současná studie poskytuje cenné údaje o klinických důsledcích antibiotik konzumovaných pacienty s COVID{16}} na SICU a míře AMR, zejména s různými komorbiditami.

Klíčová slova

citlivost na antibiotika; vzorec antimikrobiální rezistence; antimikrobiální dozor; komorbidita; COVID-19;Účinky Cistanche.

Pro získání klikněte semvýhody Cistanche

Úvod

Pandemie koronavirové nemoci 2019 (COVID-19) a antimikrobiální rezistence (AMR) jsou dva souběžné a vzájemně se ovlivňující zdravotní problémy, které poskytují významné příležitosti k učení. Mohou se vzájemně ovlivňovat, protože vzhledem k nedostatku konkrétních terapií existuje potřeba používat současné antimikrobiální látky k léčbě kriticky nemocných pacientů s COVID-19 [1]. Pandemie COVID-19 pomáhá ilustrovat možné dlouhodobé účinky AMR, které jsou méně závažné, ale ne méně kritické, protože jejich měření a výsledky jsou srovnatelné. Pochopení toho, jak COVID-19 ovlivňuje trendy AMR a co předpokládat, pokud zůstanou stejné nebo se AMR zvýší, nám pomůže naplánovat další kroky při řešení AMR [2].

Infekce COVID-19 daleko přesáhly míru bakteriální souběžné infekce a úmrtnosti ve srovnání s jinými běžnými respiračními virovými infekcemi [2]. Koinfekce SARS-CoV-2 dalšími mikroby, zejména bakteriemi a plísněmi, je určujícím faktorem rozvoje COVID-19, což komplikuje diagnostiku, léčbu a prognózu. U jedinců s COVID-19 je bakteriální koinfekce spojena s progresí onemocnění a prognózou. Tento scénář zvyšuje potřebu jednotek intenzivní péče, antibiotickou terapii a mortalitu [3]. Bohužel kvůli jejich širokému použití můžeme čelit vzniku multirezistentních patogenů (MDR), což vede ke snížení účinnosti nejsilnějších antimikrobiálních látek [3,4]. AMR je globální problém, který vážně ohrožuje úspěšnost léčby širokého spektra bakteriálních infekcí a postihuje mnoho hospitalizovaných pacientů a s největší pravděpodobností se stává vážnou hrozbou pro pacienty, kteří jsou přijati na JIP [5,6].

Celkově může selekce a vývoj bakterií vysoce rezistentních vůči lékům v důsledku zvýšeného používání antibiotik a dezinfekčních prostředků ovlivnit klinickou prognózu pacientů s těžkým COVID{1}}, kteří dostávají neodkladnou nemocniční péči, což má za následek špatné výsledky pacientů [7,8] . V této souvislosti bylo zdokumentováno, že organismy vysoce a široce odolné vůči lékům způsobují významné koinfekce u pacientů s COVID-19 a nedávno byla zaznamenána úmrtnost v situacích, kdy byly u COVID hlášeny bakteriální koinfekce{{8} } pacientů [9,10].

The bacterial co-infections that arise during SARS-CoV-2 infection must be identified and characterized in a timely fashion [11,12]. Several studies have looked into the prevalence of bacterial co-infections in COVID-19 patients, finding highly heterogeneous distributions (with differences of >50 procent), což lze přičíst klinickým a epidemiologickým charakteristikám každé geografické lokality, jakož i použitým diagnostickým metodám a kritériím [13–15]. V důsledku toho by studie hospitalizovaných pacientů mohla zlepšit naše chápání toho, jak viry a bakterie interagují během závažných onemocnění, a poskytnout podrobné informace o COVID-19 v našem prostředí. Podobně je identifikace hlavních sociodemografických a klinických faktorů spojených s bakteriální koinfekcí u pacientů s COVID{5}} zásadní pro upřednostnění potenciálních rizikových skupin a institucionální programy klinického a epidemiologického sledování, které budou vodítkem pro budoucí etiologické studie. S ohledem na hrozbu vysoké míry AMR v pandemii COVID-19 byla současná studie provedena s cílem zjistit prevalenci bakteriálních infekcí a míru AMR a dalších komorbidit s mírou úmrtnosti u pacientů s COVID-19, kteří byli přijat na SICU.

Cistanche pilulky

Materiály a metody

1. Etická úvaha

Před zahájením výzkumu bylo získáno etické schválení od Etického výboru pro lidský výzkum, University of Central Punjab, Lahore, Pákistán. Před pokračováním v odběru vzorku byl od pacienta (nebo od závislé osoby, pokud byl pacient nestabilní) získán písemný informovaný souhlas. Studovaní pacienti byli sledováni pro spotřebu antibiotik ode dne přijetí do dne propuštění (uzdravení nebo úmrtí). Demografické údaje (věk, pohlaví), komorbidity, doporučené antibakteriální léky, celkový počet daných antibakteriálních léků a názvy značek byly zaznamenány do předem definovaného sběrného listu dat.

2. Odběr vzorků

Aktuální studii provedla Katedra mikrobiologie Fakulty přírodních věd University of Central Punjab, Lahore, ve spolupráci s nemocnicí terciární péče v Lahore, Pákistán, od 2. srpna 2021 do 31. října 2021. Celkem 856 COVID{{ Do současné studie bylo přijato 5}} pozitivních pacientů (přijatých na SICU). Pro zahrnutí více pacientů byl od každého pacienta odebrán pouze jeden typ vzorku. Vzorky dýchacích cest včetně sputa (n=165), tracheálního aspirátu (n=156), bronchoalveolární laváže (n=117) ​​a pleurální tekutiny (n=3) byly odebrány pomocí další vzorky včetně moči (n=238), výtěru z rány (n=102), krve (n=60), hrotu Foleyho katétru (n=6), výtěru hnisu (n=6), a absces (n=3), abyste mohli pokračovat dále pro bakteriální kultury. Vzorky byly odebírány za sterilních podmínek a za přísných standardních operačních postupů (SOP). Po odběru vzorků byly tyto okamžitě převezeny do mikrobiologické laboratoře na University of Central Punjab, Lahore, k dalšímu zpracování.

3. Izolace a identifikace bakteriálních izolátů

Všechny vzorky kromě moči byly nejprve podrobeny barvení podle Grama, aby byly vidět mikroskopické charakteristiky bakterií, a poté, na základě typu vzorku, byly naočkovány (včetně vzorků moči) na agarové médium MacConkey, čokoládu a cysteinový elektrolyt (CLED). Po naočkování kultury byly agarové plotny inkubovány zpočátku při 37 °C po dobu 18 až 24 hodin. Po první inkubaci byly agarové plotny pozorovány na výskyt bakteriálních kolonií. V případě, že nebyly žádné bakteriální kolonie, byly misky znovu inkubovány pro druhé a třetí čtení, v daném pořadí, s výjimkou krevních kultur, které byly znovu naočkovány a znovu kontrolovány až do sedmého dne odběru vzorku. Negativní plotny byly hlášeny jako nemající "žádný bakteriální růst", zatímco pozitivní bakteriální kultury dále pokračovaly k identifikaci bakterií a AST.

Konečná bakteriální identifikace byla provedena pomocí Gramova barvení, objevení se bakteriálních kolonií na agarových plotnách a biochemické identifikace. Kolonie grampozitivních bakterií nejprve přistoupily ke katalázovému testu, a pokud byl katalázový test pozitivní, kolonie pokračovaly dále koagulázovým, DNA a optochinovým diskovým testem. Gram-negativní bakterie však byly nejprve zkoumány z hlediska jejich vzhledu jako fermentory laktózy nebo nefermentující a poté byly přistoupeny k indolovým, citrátovým a oxidázovým testům a k soupravě pro biochemickou identifikaci analytického profilu (API).

Extrakt z cistanche

4. Testování citlivosti na antibiotika (AST)

Po izolaci a identifikaci organismů byla provedena AST ke kontrole jejich citlivosti na antibiotika pomocí Kirby Bauerova diskového difúzního testu a MIC (kde je to vhodné) [16]. Bakteriální kolonie byly nejprve smíchány v předem připraveném 0,5% standardním MacFarlandově roztoku, aby se zředily kolonie, aby se zkontrolovaly vzorce citlivosti. Po inokulaci testovaného organismu byly tyto trojrozměrně naočkovány na agarovou misku Muller Hinton (MH) agar (MH) pomocí sterilního vatového tampónu.

Antibiotika byla kontrolována podle pokynů institutu klinických laboratorních standardů (CLSI) (2017) pro každý mikroorganismus [16]. Antibiotika byla nanesena na inokulované MH agarové plotny a inkubována po dobu 18 až 24 hodin při 37 °C. Po inkubační době byla měřena zóna inhibice pomocí označené měřící stupnice. Pokyny CLSI sledovaly zónu inhibice (měřenou v mm) pro každé antibiotikum v/s organismy. Konečné výsledky AST byly zaznamenány jako rezistentní, citlivé nebo střední.

Podle pokynů CLSI (2017) byla zóna inhibice pro fosfomycin dostupná pouze pro hlášení u izolátů E. coli a Enterococcus faecalis pomocí diskové difúzní metody. Vzorce citlivosti byly založeny na minimálních inhibičních koncentracích (MIC) pro všechny ostatní doporučené bakteriální izoláty.

5. Statistická analýza

Konečná data byla zaznamenána v aplikaci Microsoft Excel a přenesena do SPSS verze 26.0 (IBM, New York, NY, USA). Ze zaznamenaných dat byly vypočteny frekvence a procenta. Souvislost mezi komorbiditami a výsledkem léčby, typem bakteriální infekce a závažností COVID-19 byla analyzována pomocí Pearsonova Chi-kvadrát testu (X2), kde p-hodnota<0.05 was considered statistically significant.

Cistanche prášek

Reference

1. Clancy, CJ; Buehrle, DJ; Nguyen, MH PRO: Pandemie COVID-19 povede ke zvýšení míry antimikrobiální rezistence. JAC-Antimicrob. Odolat. 2020, 2, dlaa049.

2. Mondal, MK; Roy, BR; Yasmeen, S.; Haque, F.; Huda, AQ; Banik, D. Prevalence mikroorganismů a vznik bakteriální rezistence na JIP Bangabandhu Sheikh Mujib Medical University of Bangladesh. J. Bangladesh Soc. anesteziol. 2013, 26, 20–26.

3. Parveen, S.; Saqib, S.; Ahmed, A.; Shahzad, A.; Ahmed, N. Prevalence kolonizace MRSA mezi zdravotnickými pracovníky a účinnost dekolonizačního režimu na JIP v nemocnici terciární péče, Lahore, Pákistán. Adv. Life Sci. 2020, 8, 38–41.

4. Ventola, CL Krize antibiotické rezistence: Část 2: Strategie řízení a nové látky. Pharm. Ther. 2015, 40, 344.

5. Pickens, CI; Wunderink, RG Principy a praxe antibiotického dozoru na JIP. Hrudník 2019, 156, 163–171.

6. Laxminarayan, R.; Duse, A.; Wattal, C.; Zaidi, AK; Wertheim, HF; Sumpradit, N.; Vlieghe, E.; Hara, GL; Gould, IM; Goossens, H.; a kol. Antibiotická rezistence – potřeba globálních řešení. Lancet Infect. Dis. 2013, 13, 1057–1098.

7. Smith, R.; Coast, J. Skutečná cena antimikrobiální rezistence. BMJ 2013, 346, 1–5.

8. Dyar, OJ; Castro-Sánchez, E.; Holmes, AH Proč lidé mluví o antibiotikách na sociálních sítích? Retrospektivní analýza používání Twitteru. J. Antimicrob. Chemother. 2014, 69, 2568–2572.

9. Rytíř, GM; Glover, RE; McQuaid, CF; Olaru, ID; Gallandat, K.; Leclerc, QJ; Fuller, NM; Willcocks, SJ; Hasan, R.; van Kleef, E.; a kol. Antimikrobiální rezistence a COVID-19: Průniky a důsledky. Elife 2021, 10, e64139.

10. Monnet, DL; Harbarth, S. Bude mít koronavirová nemoc (COVID-19) vliv na antimikrobiální rezistenci? Eurosurveillance 2020, 25, 2001886.

11. Ali, Z.; Jatoi, MA; Al-Wraikat, M.; Ahmed, N.; Li, J. Čas na posílení imunity prostřednictvím funkčních potravin a doplňků: Naděje pro vypuknutí SARS-CoV-2. Alternativní. Ther. Health Med. 2020, 27, 30–44.

12. Adiga, MS; Alwar, M.; Pai, M.; Adiga, USA Vzorec antimikrobiálních látek používaných při porodech v nemocnici: Prospektivní srovnávací studie. Online J. Health Allied Sci. 2010, 8, 10.

13. Vincent, J.-L.; Rello, J.; Marshall, J.; Silva, E.; Anzueto, A.; Martin, CD; Moreno, R.; Lipman, J.; Gomersall, C.; Sakr, Y.; a kol. Mezinárodní studie prevalence a výsledků infekcí na jednotkách intenzivní péče. JAMA 2009, 302, 2323–2329.

14. Zahra, N.; Zeshan, B.; Qadri, MMA; Ishaq, M.; Afzal, M.; Ahmed, N. Fenotypové a genotypové hodnocení antibiotické rezistence bakterií Acinetobacter baumannii izolovaných od pacientů na chirurgické jednotce intenzivní péče v Pákistánu. Jundishapur J. Microbiol. 2021, 14, e113008.

15. Bataineh, HA; Alrashed, KM rezistentní gramnegativní bacily a spotřeba antibiotik v Zarqa, Jordánsko. Pak. J. Med. Sci. 2007, 23, 59–63.

16. Institut klinických laboratorních standardů. Výkonové standardy pro testování antimikrobiální citlivosti, 28. vydání; CLSI doplněk M100; Pokyny Institutu pro klinické laboratorní standardy (CLSI); CLSI: Wayne, PA, USA, 2017.

Basit Zeshan 1, Mohmed Isaqali Karobari 2,3,4, Nadia Afzal 5, Amer Siddiq 6, Sakeenabi Basha 7, Syed Nahid Basheer 8, Syed Wali Peeran 9, Mohammed Mustafa 10, Nur Hardy A. Daud Ahmed 11, 12, Chan Yean Yean 12 a Tahir Yusuf Noorani 2.

1. Ústav mikrobiologie, Fakulta přírodních věd, University of Central Punjab, Lahore 540000, Pákistán; dr.basitzeshan@ucp.edu.pk (BZ); naveed.malik@student.usm.my (NA)

2. Konzervativní stomatologická jednotka, School of Dental Sciences, Universiti Sains Malaysia, Health Campus, Kubang Kerian, Kota Bharu 16150, Kelantan, Malajsie; tahir@usm.my

3 Oddělení konzervativní stomatologie a endodoncie, Saveetha Dental College & Hospitals, Saveetha Institute of Medical and Technical Sciences University, Chennai 600077, Tamil Nadu, Indie

4 Ústav záchovné stomatologie a endodoncie, Fakulta zubního lékařství, University of Puthisastra, Phnom Penh 12211, Kambodža

5 Nemocnice základní zdravotní jednotky (BHU) Mora, Tehsil a okres Nankana Sahib, Nankana Sahib 39100, Pákistán; nadia.afzal511@gmail.com

6 Lékařská fakulta, Riphah International University, Islamabad 46000, Pákistán; 5400@students.riphah.edu.pk

7 Katedra komunitního zubního lékařství, Fakulta zubního lékařství, Univerzita Taif, PO Box 11099, Taif 21944, Saúdská Arábie; sakeena@tudent.edu.sa

8 Department of Restorative Dental Sciences, College of Dentistry, Jazan University, Jazan 45142, Saudi Arabia; syednahidbasheer@gmail.com

9 Department of Periodontics, Armed Forces Hospital Jizan, Jazan 82722, Saudi Arabia; doctorsyedwali@yahoo.in

10 Katedra konzervativních zubních věd, College of Dentistry, Univerzita prince Sattama Bin Abdulazize, PO Box 173, Al-Kharj 11942, Saúdská Arábie; ma.mustafa@psau.edu.sa

11 Fakulta udržitelného zemědělství, Universiti Malaysia Sabah, Sandakan Campus, Locked Bag No.3, Sandakan 90509, Sabah, Malajsie; nur.hardy@ums.edu.my

12 Department of Medical Microbiology and Parasitology, School of Medical Sciences, Universiti Sains Malaysia, Kubang Kerian, Kota Bharu 16150, Kelantan, Malaysia; yychan@usm.my