Scientometrická analýza savčího cíle signální dráhy rapamycinu u onemocnění ledvin v letech 1986 až 2020, část 2

Recenze milníků autorů a literatury 

A total of 14,045 researchers had published the 2,585 manuscripts and the number of authors in every paper on average was 5.43. We used CiteSpace and VOSviewer to analyze co-authorship and citation networks among authors and to reveal the most highly cited researchers and collaboration among researchers. "Key researcher" was referred to as someone whose literature had been cited more than 500 times (global citation score >500). Uzly indikovaly různé výzkumníky. Čáry mezi uzly představovaly spolupráci mezi autory a velikost uzlu ukazovala počet prací publikovaných autorem (obrázek 3C, D). Linehan WM, Schmidt LS, Sommerer C, Kasinath BS, Aburatani H a Baba M významně přispěli k výzkumu signální dráhy mTOR vnemoc ledvin. Linehan WM publikoval 24 prací v této oblasti výzkumu. Linehan WM, Schmidt LS a Huber TB, které lze považovat za lídry této výzkumné oblasti, obdrželi každý přes 1,{2}} citaci. Linehan WM a Aburatani H spolupracovali na mnoha článcích, ale jejich spolupráce s Kwiatkowski DJ nebyla tak častá (obrázek 3D). 2 585 druhů literatury o signálních drahách mTOR vnemoc ledvinve svých odkazech také citovali jeden druhého nebo několik dalších studií. Využili jsme CiteSpace k analýze 71 544 odkazů na jejich složení a vytvořili 20 nejsilnějších citačních shluků a zjednodušenou síť společných citací (obrázek 3E, F). Číslo citovanosti těchto publikací náhle vzrostlo během období, které odhalilo rychlé přijetí a rozšíření v konkrétních oblastech výzkumu a zaujímalo velmi důležité pozice ve znalostním rámci.

Vizualizace klíčových slov a pojmů MeSH

Frekvence výskytu a časový trend klíčových slov a termínů MeSH byly vizualizovány programem CiteSpace a VOSviewer. Extrahovat klíčové koncepty mTOR innemoc ledvin, jsme použili systém Carrot2 k analýze hlavních témat. V červeném rámečku bylo 6 nejlepších klíčových slov, což představovalo nejvyšší míru výskytu u výrazů „Recipients Transplanted“, „Investigated the Effects ofmTOR", "Akt Expression", "Target Genes", "Mammalian Target of Rapamycin Signaling" a "Therapy to a savčí Target of Rapamycin" (Obrázek 4A). Na základě CiteSpace byla síť společných citací rozdělena do různých různorodých shluků od názvy citovaných článků (obr. 4B) Síťová vizualizace klíčových slov a shlukování mTOR byly založeny na programu VOSviewer (obr. 4C, D).

Software CiteSpace byl použit k analýze zobrazení časového pásma a zobrazení časové osymTORsignální dráha vnemoc ledvinspolucitační síť. Čas zveřejnění byl odhalen v horní části pohledu. Obrázek pro uzly ve vodorovné linii znázorňoval důležitost studijního oboru a vazbu mezi uzly odrážející citování. Časová osa také ukazovala výskyt, popularitu a pokles výzkumných subjektů v nejtypičtějších publikacích.

Obrázek 4Vizualizace klíčových slov a pojmů MeSH. (A) Analýza klíčových slov pro signální dráhu mTOR u onemocnění ledvin. (B) Shluková analýza kocitační sítě pro signální dráhu mTOR u onemocnění ledvin. (C) Síťová vizualizace klíčových slov. (D) Tepelná mapa klíčových slov.

Mezitím shluky odrážely časové charakteristiky výzkumných oblastí v zobrazení časové osy. Vývoj klastru 10 (vazebný protein) ukázal časné prozkoumání dráhy mTOR vledvinavýzkum zaměřený na vazebný protein, k němuž došlo nejdříve. Cluster 0 (transplantaci ledviny), shluk 1 (autosomálně dominantní polycystickýnemoc ledvin), shluk 4 (karcinom ledvin), shluk 5 (diabetická nefropatie), shluk 7 (renální angiomyolipom) a shluk 13 (neglykemická onemocnění) byly současnými hranicemi a zaměřeními výzkumu (obrázek 5A). Výsledky analýzy klíčových slov časové osy odhalily inhibitor kalcineurinu, diabetickou nefropatii, autosomálně dominantní polycystikunemoc ledvin,a komplex tuberózní sklerózy (obrázek 5B). Současný výzkum se zaměřuje na mechanismus a komplikacenemoc ledvin. Pohled na časové pásmo klastrových uzlů byl ilustrován, když síť společných citací citovala publikace, které také mohly demonstrovat pokrok výzkumu v čase (obrázek 5C). A centrální spojení mezi časovými pásmy odhalilo, do jaké míry zpráva chyběla nebo byla zpráva potvrzena, aby stimulovala odhalení a podpořila vyšetřování. Pokud by ve vizualizaci časového pásma bylo více druhů literatury, bylo by to významné období (obrázek 5C).

K označení a vytvoření vědeckých souvislostí a příspěvků byla použita analýza duální mapy. Citující osnova je v levé polovině a citovaná osnova je v pravé polovině. Citační asociační čára v trajektorii z jednoho regionu do druhého by ilustrovala porozumění meziodborovým vztahům, a tím by vedla k propojení a znalostem různých oblastí výzkumu (obrázek 5D).

Obrázek 5Zobrazení časové zóny uzlů clusteru a vizualizace klíčových slov a termínů MeSH na časové ose. (A) Vizualizace časové osy termínu od roku 1986 do roku 2020. (B) Vizualizace časové osy klíčových slov od roku 1986 do roku 2020. (C) Vizualizace pohledu na časové pásmo uzlů clusteru. (D) Duální mapové překryvy publikací o mTOR u onemocnění ledvin.

Diskuse 

Na rozdíl od tradičních recenzí může bibliometrická analýza systematicky zpracovávat rukopisy v souvisejících oblastech výzkumu, aby získala intuitivnější a jasnější výsledky. Pro nové výzkumníky v konkrétních oblastech může být užitečné sledovat aktuální zaměření studie a celkové trendy a odhalit přelomové druhy literatury v oboru. Kromě toho je snadné a uživatelsky přívětivé ovládat současný software pro analýzu bibliometrické analýzy. V současném výzkumu jsme prezentovali bibliometrickou analýzu týkající se signální dráhy mTOR vnemoc ledvin.

Podle relevantních studií v posledních letech proběhl výzkum využití kmenových buněk a čínského bylinného léku k léčběonemocnění ledvinzískal velkou pozornost. Hlavním mechanismem těchto dvou terapií je podpora opravy poraněných ledvinových tkání achránit zbývající renální funkce.

Čínský bylinný lék,cistanche, byl používán v tradiční čínské medicíně k léčbě různých chronickýchonemocnění ledvinod pradávna. Uvádí se, žecistanchemá potenciál snížit zánět,snížit fibrózu ledvina podporují syntézu složek extracelulární matrice. Bylo zjištěno, že tyto účinky jsou způsobeny jeho bioaktivními složkami, včetně mnoha fenolických látek, triterpenoidů a kumarinů.

Kliknutím sem se dozvíte o organické Cistanche pro onemocnění ledvin

Požádat o víc:

david.deng@wecistanche.com WhatApp:86 13632399501

Na druhou stranu technologie kmenových buněk způsobila revoluci v lékařské praxi. Výzkum prokázal, že kmenové buňky se mohou diferencovat na různé typy ledvinových buněk a provádět terapeutické aktivity, včetně ochrany zbývajících funkčních ledvinových tkání, zpomalení tkáňové fibrózy a opravy poškozených ledvinových tkání.

V konečném důsledku by kombinace tradiční čínské medicíny s moderní vědou mohla být klíčem k léčbě různých druhůonemocnění ledvin.Tato strategie byla postupně přijata lékařskou komunitou a studie již ukázaly, že kombinovaná terapie cistanche a léčba kmenovými buňkami může výrazně snížit úmrtnostonemocnění ledvin. 

Závěrem je použití cistanche a léčby kmenovými buňkami při léčběonemocnění ledvinvykazuje velký potenciál a vyžaduje další výzkum. Kombinovaná terapie těchto dvou léčebných postupů by mohla poskytnout zlepšenou možnost léčby pro ty, kteří čelíonemocnění ledvin.

Na základě výsledků bylo z WoSCC extrahováno celkem 2 585 druhů literatury se 71 544 odkazy. Počet rukopisů se každým rokem zvyšuje. I když je signální dráha mTOR odvětvím celkového výzkumuledviny, jeho výzkumný trend se v poslední době postupně zvyšuje (obrázek 2A). V této oblasti jsou významnější USA, Čína a Německo, které tvoří 55,7 procenta publikací. Pět z 20 nejproduktivnějších institucí je ve Spojených státech (tabulka 1), což ukazuje, že kvalita literatury vydávané americkými institucemi je vyšší. Výzkumné instituce, jako je Harvardská univerzita (obr. 2F, G, H), jsou v této specifické oblasti poměrně vyspělé a lze je považovat za významné instituce pro učení a další spolupráci. Tyto výsledky naznačují, že USA zaujímá vedoucí pozici v signální dráze mTOR vnemoc ledvin, což se odráží především v mezinárodní spolupráci, celkovém počtu citací a počtu publikací. Zejména ve srovnání s Německem a Anglií se po roce 2014 dramaticky zvýšily publikace jiných evropských zemí, jako je Itálie a Švýcarsko, což ukazuje, že rozvinutější země/regiony se budou věnovat dalšímu zkoumání v této oblasti (obrázek 2E).

Časopisy ve stejném clusteru mají stejnou oblast výzkumu. Pomocí funkce softwaru VOSviewer jsme rozdělili 100 nejlepších časopisů do tří skupin (obrázek 3B). Na základě CiteSpace byla detekována celá výzkumná pole a rozdělena do čtrnácti podskupin a sedm největších shluků je zobrazeno na obrázku 4B, včetně shluku 0".transplantaci ledviny“, cluster 1 „autosomálně dominantní polycystickýnemoc ledvin", shluk 2 "transplantace ledvin", shluk 3 "karcinom ledvinových buněk", shluk 4 "hamartin", shluk 5 "autofagie" a shluk 6 "komplex tuberózní sklerózy". Shluk 3 "karcinom ledvinových buněk" naznačují, že mTOR je významný v výzkum renálního karcinomu (RCC) a to, že antiproliferativní vlastnost inhibitorů mTOR může potlačovat růst nádorů.RCC je na sedmém a devátém místě mezi muži a ženami a počet nových případů rakoviny bude v budoucnu narůstat (29) Chirurgická resekce je hlavní metodou léčby nádorů, které jsou omezeny na ledvinu. Asi jedna třetina pacientů má vzdálené metastázy a většina případů je nevyléčitelná. Interferon je široce používán u translokačního renálního karcinomu, ale jeho účinnost a tolerance jsou omezené. Proto se do popředí zájmu dostávají nové terapeutické cíle mTOR (30,31). Použili jsme CiteSpace k provedení společné citační analýzy a určili několik milníků literatury (obrázek 3F). Například Linehan WM odhalil genetický základ RCC a roli dráhy mTOR v její patogenezi (32). Hudes a kol. také hodnotili temsirolimus jako inhibitor mTOR pro RCC (33). Serra a kol. hodnotili sirolimus a růst ledvin u autozomálně dominantních polycystickýchnemoc ledvin(34). Práce Laplante et al. má největší citační vzplanutí (obrázek 3F): signalizace mTOR při kontrole růstu a onemocnění (4). Shillingford a kol. vypracovali, že inhibice dráhy mTOR by mohla zvrátit renální cystogenezi u polycystickýchnemoc ledvin(35). Rukopis byl zařazen do shluku 1 „autosomálně dominantní polycystickýnemoc ledvin“ a cluster 5 „autofagie“.

Čtenáři mohou autoritativně rozpoznat mechanismus mTOR intransplantaci ledviny, rakovina ledvin a komplex renální tuberózní sklerózy a jejich léčbanemoc ledvinprostřednictvím těchto milníkových rukopisů. Podle obrázků 5A a B je vývoj mTOR vnemoc ledvinza určitý čas je jasně zobrazen. Inhibitor kalcineurinu je aktivním bodem výzkumu a výzkumníci ilustrovali srovnání inhibitorů kalcineurinu a inhibitorů mTOR k léčběnemoc ledvin(13,36,37). Kromě toho výzkum signální dráhy mTOR vnemoc ledvinmůže začít souviset s mTOR (38-40). K rozpoznání důležitých klíčových slov jsme použili VOSviewer a Carrot2 (obrázek 4A, C, D). Mezi aktivními body na obrázku 4C, D je více názvů léků, jako je rapamycin, sirolimus, everolimus a tak dále. V roce 1999 schválil americký Úřad pro kontrolu potravin a léčiv (FDA) uvedení rapamycinu na trh jako nové možnosti léčby k prevenci odmítnutí orgánu u příjemců transplantátu ledvin (41). Proto se výzkum rapamycinu soustředí hlavně kolem roku 2000 (obrázek 4C). V březnu 2010 získal everolimus souhlas americké FDA a Evropské lékové agentury pro léčbu pokročilého RCC a transplantaci ledvin (42). A tak se výzkum everolimu a transplantace ledvin nejvíce zaměřil na rok 2010 (obrázek 4C). Analyzovali jsme časové trendy klíčových slov pomocí CiteSpace (obrázek 5A, B, C). Diabetická nefropatie,transplantaci ledviny, autozomálně dominantní polycystické onemocnění ledvin, komplex tuberózní sklerózy, renální buněčný karcinom a autofagie by mohly být výzkumnými středisky v příštích několika letech.

Podle duálních překryvných map (obrázek 5D) nám trajektorie citace říká, že medicína a biologie jsou dominantními oblastmi signální dráhy mTOR vnemoc ledvina mTOR má malý vztah s jinými disciplínami. Chiew a kol. vyobrazil trojrozměrnou platformu pomocí fluorescenčního rezonančního senzoru kaspázy-3 založeného na přenosu energie k detekci apoptotické schopnosti inhibitorů mTOR (43). S dalším výzkumem o signalizaci mTOR vnemoc ledvin, zapojí se případně i další subjekty. Tato studie má však určitá omezení, která je třeba vzít v úvahu při analýze výsledků výzkumu. Za prvé, literatura je extrahována pouze z databáze WoSCC, což by mohlo vést k neúplnému načtení dokumentu. Za druhé, detekovali jsme některé shluky, jako je hemangiom jater a epiteliální buňky tlustého střeva, které nejsou úzce spjaty snemoc ledvin.

Závěry

Budoucí výzkumné hotspoty budou zahrnovat diabetickou nefropatii,ledvinatransplantace, autosomálně dominantní polycystickýnemoc ledvin,komplex tuberózní sklerózy, renální buněčný karcinom a autofagie. Na základě různých vědeckých metod může poskytnout budoucí směr výzkumu těm, kteří do této oblasti vstoupili poprvé.

Poděkování

Financování: Tato práce byla podpořena National Natural Science Foundation of China (číslo grantu 81703851).

Reference

1. Aleman JO, Eusebi LH, Ricciardiello L, et al. Mechanismy obezitou indukované gastrointestinální neoplazie. Gastroenterologie 2014;146:357-73.

2. D'Agati VD, Chagnac A, de Vries AP, et al. Glomerulopatie související s obezitou: klinické a patologické charakteristiky a patogeneze. Nat Rev Nephrol 2016;12:453-71.

3. Blandino-Rosano M, Barbaresso R, Jimenez-Palomares M, et al. Ztráta signalizace mTORC1 zhoršuje homeostázu beta buněk a zpracování inzulínu. Nat Commun 2017;8:16014.

4. Laplante M, Sabatini DM. mTOR signalizace při kontrole růstu a onemocnění. Buňka 2012;149:274-93.

5. Li J, Kim SG, Blenis J. Rapamycin: jeden lék, mnoho účinků. Cell Metab 2014;19:373-9.

6. Uno K, Yamada T, Ishigaki Y, a kol. Signální dráha závislá na jaterních aminokyselinách/mTOR/S6K moduluje systémový metabolismus lipidů prostřednictvím neuronálních signálů. Nat Commun 2015;6:7940.

7. Kim K, Qiang L, Hayden MS, a kol. Raptor nezávislý na mTORC1- zabraňuje steatóze jater stabilizací PHLPP2. Nat Commun 2016;7:10255.

8. Han J, Li E, Chen L, a kol. Koaktivátor CREB CRTC2 řídí metabolismus lipidů v játrech regulací SREBP1. Příroda 2015;524:243-6.

9. Lipton JO, Sahin M. Neurologie mTOR. Neuron 2014;84:275-91.

10. Bockaert J, Marin P. mTOR in Brain Physiology and Patology. Physiol Rev 2015;95:1157-87.

11. Crino PB. Signalizační kaskáda mTOR: dláždění nových cest k léčbě neurologických onemocnění. Nat Rev Neurol 2016;12:379-92.

12. Ardestani A, Lupse B, Kido Y, a kol. Signalizace mTORC1: Dvojsečný meč v beta buňkách diabetu. Cell Metab 2018;27:314-31.

13. Fantus D, Rogers NM, Grahammer F, a kol. Role komplexů mTOR v ledvině: důsledky pro onemocnění ledvin a transplantaci. Nat Rev Nephrol 2016;12:587-609.

14. Shiels PG, McGuinness D, Eriksson M, et al. Role epigenetiky ve stárnutí ledvin. Nat Rev Nephrol 2017;13:471-82.

15. Orhon I, Dupont N, Zaidan M, et al. Primárně-cilium-dependentní autofagie řídí objem epiteliálních buněk v reakci na průtok tekutiny. Nat Cell Biol 2016;18:657-67.

16. Grahammer F, Nesterov V, Ahmed A, et al. mTORC2 kriticky reguluje renální manipulaci s draslíkem. J Clin Invest 2016;126:1773-82.

17. MacKeigan JP, Krueger DA. Odlišení inhibitorů mTOR everolimu a sirolimu v léčbě komplexu tuberózní sklerózy. Neuro Oncol 2015;17:1550-9.

18. Menezes LF, Germino GG. Patobiologie polycystické choroby ledvin z metabolického hlediska. Nat Rev Nephrol 2019;15:735-49.

19. Gui Y, Lu Q, Gu M, a kol. Osa Fibroblast mTOR/PPARgamma/HGF chrání před smrtí tubulárních buněk a akutním poškozením ledvin. Cell Death Differ 2019;26:2774-89.

20. Choueiri TK, Je Y, Sonpavde G, et al. Výskyt a riziko mortality související s léčbou u pacientů s rakovinou léčených savčím cílem inhibitorů rapamycinu. Ann Oncol 2013;24:2092-7.

21. Gimpel C, Bergmann C, Bockenhauer D, et al. Mezinárodní konsensus o diagnostice a léčbě autozomálně dominantní polycystické choroby ledvin u dětí a mladých lidí. Nat Rev Nephrol 2019;15:713-26.

22. Allison SJ. Glomerulární onemocnění: mTOR u FSGS. Nat Rev Nephrol 2017;13:260.

23. van Eck NJ, Waltman L. Shlukování publikací založené na citacích pomocí CitNetExplorer a VOSviewer. Scientometrie 2017;111:1053-70.

24. Chen C, Song M. Vizualizace oblasti výzkumu: Metodologie systematických scientometrických přehledů. PLoS One 2019;14:e0223994.

25. Schargus M, Kromer R, Druchkiv V, et al. Top 100 papírů v suchém oku - bibliometrická analýza. Ocul Surf 2018;16:180-90.

26. Sugimoto CR, Ahn YY, Smith E, et al. Faktory ovlivňující zpravodajství související s pohlavím v lékařském výzkumu: mezioborová bibliometrická analýza. Lancet 2019;393:550-9.

27. Fedewa MV, Hathaway ED, Ward-Ritacco CL. Vliv cvičení na C reaktivní protein: systematický přehled a metaanalýza randomizovaných a nerandomizovaných kontrolovaných studií. Br J Sports Med 2017;51:670-6.

28. Yu L, McPhee CK, Zheng L a kol. Ukončení autofagie a reformace lysozomů regulovaných mTOR. Příroda 2010;465:942-6.

29. Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Cancer Statistics, 2019. CA Cancer J Clin 2019;69:7-34.

30. Haas NB, Appleman LJ, Stein M, et al. Autofagická inhibice k zesílení inhibice mTOR: Fáze I/II studie everolimu a hydroxychlorochinu u pacientů s dříve léčeným renálním karcinomem. Clin Cancer Res 2019;25:2080-7.

31. Xu J, Pham CG, Albanese SK, a kol. Mechanicky odlišné shluky aktivace mTOR asociované s rakovinou předpovídají citlivost na rapamycin. J Clin Invest 2016;126:3526-40.

32. Linehan WM, Schmidt LS, Crooks DR a kol. Metabolický základ rakoviny ledvin. Cancer Discov 2019; 9:1006-21.

33. Hudes G, Carducci M, Tomczak P, a kol. Temsirolimus, interferon alfa nebo oba u pokročilého renálního karcinomu. N Engl J Med 2007;356:2271-81.

34. Serra AL, Poster D, Kistler AD, et al. Sirolimus a růst ledvin u autozomálně dominantní polycystické choroby ledvin. N Engl J Med 2010;363:820-9.

35. Shillingford JM, Murcia NS, Larson CH, et al. Dráha mTOR je regulována polycystinem-1 a jeho inhibice obrací renální cystogenezi u polycystických ledvin. Proč Natl Acad Sci USA 2006;103:5466-71.

36. Guo Z, Hong SY, Wang J, et al. Makrocykly inspirované rapamycinem s novou cílovou specificitou. Nat Chem 2019; 11:254-63.

37. Budde K, Becker T, Arns W, a kol. Režim založený na everolimu, bez kalcineurinových inhibitorů u příjemců transplantace ledvin de novo: otevřená, randomizovaná, kontrolovaná studie. Lancet 2011;377:837-47.

38. Henske EP, Jozwiak S, Kingswood JC, et al. Komplex tuberózní sklerózy. Nat Rev Dis Primers 2016;2:16035.

39. Narita M, Young AR, Arakawa S, et al. Prostorové spojení mTOR a autofagie rozšiřuje sekreční fenotypy. Science 2011;332:966-70.

40. Natoli TA, Smith LA, Rogers KA, et al. Inhibice akumulace glukosylceramidu vede k účinné blokádě polycystického onemocnění ledvin u myších modelů. Nat Med 2010;16:788-92.

41. Miller JL. Sirolimus schválen s indikací transplantace ledviny. Am J Health Syst Pharm 1999;56:2177-8.

42. StatBite: FDA schválení onkologických léčivých přípravků v roce 2009. J Natl Cancer Inst 2010;102:219.

43. Chiew GGY, Wei N, Sultania S, et al. Bioinženýrská trojrozměrná kokultivace rakovinných buněk a endoteliálních buněk: Modelový systém pro duální analýzu růstu nádoru a angiogeneze. Biotechnol Bioeng 2017;114:1865-77.

Požádejte o více: david.deng@wecistanche.com